MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_78p

Total Repeats: 387

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018879	T	6	6	9	14	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018879	AT	3	6	173	178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018879	TAT	2	6	180	185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018879	TAAA	2	8	198	205	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018879	AATA	2	8	207	214	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018879	ATACAT	2	12	215	226	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_018879	AAC	2	6	272	277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018879	TTC	2	6	283	288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018879	AT	3	6	377	382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018879	TAA	2	6	412	417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018879	CAA	2	6	467	472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018879	CAT	2	6	484	489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018879	TAA	2	6	544	549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018879	TG	3	6	556	561	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018879	GGGA	2	8	642	649	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018879	GCCT	2	8	715	722	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_018879	G	6	6	759	764	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018879	ATA	2	6	765	770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018879	AGA	2	6	892	897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018879	T	6	6	921	926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018879	GCC	2	6	987	992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_018879	T	7	7	1045	1051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018879	TC	3	6	1097	1102	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018879	ATTT	2	8	1121	1128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018879	TAAT	2	8	1152	1159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018879	CAA	2	6	1206	1211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018879	ATT	2	6	1278	1283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018879	T	7	7	1282	1288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018879	AAAT	2	8	1385	1392	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018879	ATTT	2	8	1400	1407	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018879	TTC	2	6	1448	1453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018879	T	6	6	1505	1510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018879	AATA	2	8	1602	1609	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018879	GGT	2	6	1647	1652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018879	AAG	2	6	4114	4119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018879	ATTA	2	8	4175	4182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018879	ATA	3	9	4199	4207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018879	ATATT	2	10	4213	4222	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018879	A	7	7	4499	4505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018879	A	7	7	4521	4527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018879	TTCT	2	8	4533	4540	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_018879	T	6	6	4565	4570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018879	A	6	6	5996	6001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018879	T	6	6	6506	6511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018879	T	7	7	6530	6536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018879	GTTGA	2	10	6626	6635	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018879	GAA	3	9	6711	6719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018879	T	6	6	6734	6739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018879	TAAA	2	8	6823	6830	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018879	ATAGC	2	10	6842	6851	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_018879	AAG	2	6	6891	6896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018879	CTT	2	6	6914	6919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018879	A	6	6	6931	6936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018879	ATC	2	6	6939	6944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018879	GGTG	2	8	6948	6955	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018879	T	6	6	6960	6965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018879	TAA	2	6	6973	6978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018879	AC	3	6	7285	7290	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_018879	T	6	6	7293	7298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018879	TA	3	6	7304	7309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018879	ATAA	2	8	7323	7330	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018879	CAAC	2	8	7690	7697	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_018879	TAT	2	6	7776	7781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018879	TA	3	6	7798	7803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018879	TCC	2	6	8201	8206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_018879	T	6	6	8208	8213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018879	CTT	2	6	8223	8228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018879	A	7	7	8679	8685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018879	T	7	7	9286	9292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018879	TGTT	2	8	9311	9318	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018879	T	6	6	9320	9325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018879	TCC	2	6	9615	9620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_018879	AT	3	6	10023	10028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018879	ATA	2	6	10038	10043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018879	A	6	6	10049	10054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018879	TAT	2	6	10060	10065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018879	TA	3	6	10076	10081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018879	ATAA	2	8	10088	10095	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018879	TTTA	2	8	10171	10178	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018879	ATA	2	6	10207	10212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018879	GTTT	2	8	10430	10437	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018879	TTA	2	6	10439	10444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018879	T	6	6	10470	10475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018879	A	7	7	10481	10487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018879	TAT	2	6	10495	10500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018879	ATT	2	6	10515	10520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018879	AGTTG	2	10	10611	10620	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018879	CTT	2	6	10687	10692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018879	T	7	7	10798	10804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018879	GTTTT	2	10	10841	10850	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018879	A	6	6	10907	10912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018879	AGCTGC	2	12	10917	10928	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018879	T	6	6	10938	10943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018879	CTC	2	6	12328	12333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_018879	TAC	2	6	12346	12351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018879	AACAAA	2	12	12357	12368	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_018879	TAAG	2	8	12371	12378	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018879	TAT	2	6	12381	12386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018879	A	6	6	12397	12402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018879	TAAAT	2	10	12425	12434	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018879	TAT	2	6	12452	12457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018879	AG	3	6	12475	12480	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018879	TC	3	6	12494	12499	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_018879	TAA	3	9	12514	12522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018879	A	6	6	12521	12526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018879	CCT	2	6	16329	16334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_018879	TAA	2	6	16375	16380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018879	AAT	2	6	16384	16389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018879	A	7	7	16435	16441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018879	TC	3	6	16464	16469	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_018879	TC	3	6	16482	16487	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_018879	AATTA	2	10	16488	16497	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018879	A	6	6	16507	16512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018879	ATTTAG	2	12	16516	16527	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018879	TAT	2	6	16579	16584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018879	ATTA	3	12	16596	16607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018879	ATT	2	6	16641	16646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018879	TTC	2	6	16767	16772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018879	ATTT	2	8	16805	16812	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018879	GTA	2	6	16826	16831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018879	TAC	2	6	16848	16853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018879	TAA	2	6	17868	17873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018879	TTC	2	6	19031	19036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018879	TTA	2	6	19055	19060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018879	GAA	2	6	19107	19112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018879	TTTTA	2	10	19113	19122	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018879	CT	3	6	19126	19131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_018879	ATT	3	9	21112	21120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018879	CAT	2	6	21136	21141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018879	T	6	6	21141	21146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018879	CTT	2	6	21529	21534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_018879	CAT	2	6	21555	21560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018879	TAA	2	6	22384	22389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018879	GTT	2	6	22406	22411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018879	TTG	2	6	22416	22421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018879	AAC	2	6	22456	22461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_018879	T	6	6	22532	22537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018879	CT	3	6	22822	22827	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_018879	CCT	2	6	23258	23263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_018879	A	6	6	23271	23276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018879	T	6	6	23313	23318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018879	ACA	2	6	24097	24102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_018879	TC	3	6	24707	24712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_018879	ATT	2	6	24724	24729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018879	TA	3	6	24735	24740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018879	AT	3	6	24759	24764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018879	TAT	2	6	24787	24792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018879	CTT	2	6	24830	24835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_018879	TTAT	2	8	24851	24858	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018879	TAT	2	6	24873	24878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018879	TTAT	2	8	24885	24892	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018879	ATAA	2	8	24923	24930	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018879	ATT	2	6	24936	24941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_018879	TAA	2	6	24965	24970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.